Der Konfirmandenunterricht beginnt mit dem 9. Schuljahr. Eine Anmeldung ist hierfür nötig. Der Unterricht ist aufgeteilt in verpflichtende Inhalte (40 Lektionen) und zusätzliche Wahlmöglichkeiten (max. 44 Lektionen). Von 10 Wahlmodulen müssen mindestens 6 besucht werden. 12 Gottesdienstbesuche bzw. Sozialeinsätze im Zeitraum des Konfunterrichts sind Voraussetzung für die Konfirmation.
Voraussetzung zur Teilnahme am Konfirmandenunterricht ist der Besuch des Religionsunterrichtes ab der 3. Klasse bez. ab der 4. Klasse für Jahrgänge vor 2021 und der erwünschten Aktivitäten in Bezug auf Gottesdienstbesuche in unserer Gemeinde.
Die Konfirmation bildet den Abschluss des kirchlichen Unterrichts und ist zugleich die selbständige Wiederholung des von den Eltern einst gegebenen Taufversprechens. In Märstetten findet die Konfirmation jeweils am Auffahrtstag und bei Bedarf am Sonntag vorher statt (Ausnahmen werden rechtzeitig mitgeteilt). Sie wird von den Konfirmanden und Konfirmandinnen mitgestaltet.